El programa PDF4QT
PDF4QT es un editor de código abierto de PDF 
multiplataforma. Realmente es un conjunto o suite de cuatro aplicaciones con una gran cantidad de características. Su licencia LGPLv3 que es una de las muchas de las licencias de código abierto que existen con lo que no genera ningún costo.
Con esta herramienta podemos editar un PDF, alterar sus metadatos, y tienen como mejor desempeño para la comprobación de accesibilidad en poder conocer el orden de lectura gracias a su lector de PDF.
LibreOffice
LibreOffice es una alternativa libre a MS Office. Tiene procesador de textos, presentaciones, hoja de cálculo, editor de dibujo vectorial y base de datos.
LibreOffice Writer es el equivalente a MS Word. Pero tiene una potente exportación a PDF.
LibreOffice Draw es el programa de dibujo vectorial con una posibilidad de poder editar PDF en cierta medida.
PDF Accessibility Checker
La aplicación PDF Accessibility Checker es conocida por PAC y es un comprobador de accesibilidad de PDF.
La ventaja, aparte de ser gratuito, es que comprueba tanto el cumplimiento de las normas WCAG como que el PDF pueda considerarse como PDF/UA.
OnlyOffice
OnlyOffice es otra alternativa libre a MS Office, en particular a MS Office 365 web, porque está pensado como solución en la nube para documentos colaborativos. Pero resulta que tiene versión de escritorio que como añadido tiene un editor de PDF con inclusión de formularios, lo que le convierte en un buen competidor de Adobe Acrobat gratuito.
Otra opción, aunque menos flexible es Stirtling-PDF que se requiere de una instalación de escritorio más compleja. Pero está ahí, y es software de código abierto. Se puede probar en la versión demo .